Representación
España
A nivel nacional, Cooperativas Agro-alimentarias de España es miembro de las principales entidades, organismos e instituciones del sector agroalimentario, tanto de carácter general como sectoriales:

Consejo Económico y Social (CES), Instituciones de Economía Social: Confederación Empresarial de la Economía Social (CEPES), CIRIEC, Patronato de Estudios Cooperativos; Consejero General de Organizaciones Interprofesionales Agroalimentarias (OIAs), Observatorio de Precios de los Alimentos, Fundación Sabor y Salud, Patrimonio Comunal Olivarero, Asociación Española de Alfalfa Deshidratada (AEFA), Asociación Española de Técnicos Cerealistas (AETC), Comisión Nacional de Producción Integrada, Comisión de Evaluación de Productos Fitosanitarios, Comisión Nacional de Estimación de Semillas, Comité Nacional de Coordinación y Seguimiento de la Gestión de Ayudas a la Mejora de la Transformación y Comercialización de los productos agrícolas y silvícolas, Comisión General de la Entidad Estatal de Seguros Agrarios (ENESA), IPAE, Observatorio de la Cadena Alimentaria, Observatorio Permanente de Seguridad Alimentaria (OPSA);

Y de las Interprofesionales del Huevo y sus Productos (INPROVO), del Pan (INCERHPAN), de Leche y Productos Lácteos (INLAC), la del Limón y Pomelo (AILIMPO), del Vino (OIVE), del Porcino Ibérico (ASICI), del Porcino Blanco (INTERPORC), del Vacuno de Carne (PROVACUNO), de la Alimentación Animal (INTERAL), Asociación 5 al Día, de la Aceituna de Mesa (INTERACEITUNA), la de Ovino y Caprino (INTEROVIC), la de Forrajes Deshidratados (AIFE), INTERCUN (Interprofesional Cunícola) y la Interprofesional de Aceite de Oliva Español, entre otras.

Internacional
En el ámbito internacional, Cooperativas Agro-alimentarias de España lleva a cabo su función representativa a través de la participación en la Confederación de Cooperativas Agroalimentarias de la UE, COGECA, organización de la que es miembro de pleno derecho, representando a las cooperativas españolas.
Esta participación conlleva el pago de la cuota anual que otorga el derecho a participar en sus órganos de Gobierno (Presidencia, Presidium) y en los distintos Grupos de Trabajo sectoriales y generales. A través de esta organización europea, Cooperativas Agro-alimentarias de España participa en los Grupos de Diálogo Civil, que son los foros consultivos de la Comisión Europea con las organizaciones representativas de los intereses afectados por la Política Agraria Común.
También en el ámbito internacional, Cooperativas Agro-alimentarias de España ejerce su función representativa de forma directa ante la Comisión Europea, el Parlamento Europeo, el Consejo Económico y Social Europeo, el Comité de las Regiones y otros organismos e instituciones a través de múltiples reuniones, entrevistas y propuestas canalizadas documentalmente sobre las cuestiones que resultan de interés para las cooperativas agroalimentarias españolas. Se elaboran y aportan las tareas necesarias para la definición de las posiciones o propuestas de utilidad final para las Instituciones de la Unión Europea.
La función representativa internacional también se desempeña a través de numerosas reuniones bilaterales del delegado de Cooperativas Agro-alimentarias de España en Bruselas, Juan Corbalán, directamente con funcionarios de la Comisión Europea, parlamentarios europeos, funcionarios de la Representación Permanente de España ante la UE, etc.